燃煤鍋爐的煙塵、二氧化硫（SO2）和氮氧化物（NOx)等大氣污染物的主要排放源。但是，循環流化床鍋爐的床溫保持在800-900℃之間，而這一溫度區間正是脫硫反應效率最高的溫度區間。因而，在適當的鈣硫比和石灰石粒度下，可獲得高達80%--90%的脫硫率。

另外，由于較低的燃燒溫度，采用分級送風，使循環流化床鍋爐燃燒時產生的氮氧化物也遠低于煤粉爐。 因此，循環流化床燃煤鍋爐的二氧化硫和氮氧化物排放量都較低。